47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2466 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  54.25 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  37.24 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  26.85 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  29.36 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  23.98 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  29.25 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  30 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  25.25 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  26 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  26.39 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  26.39 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  27.22 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  27.22 
 
 		 367 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  27.22 
 
 		 367 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  24.12 
 
 		 354 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  28.4 
 
 		 362 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  29.92 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  25.99 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  25.44 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  27.35 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  24.35 
 
 		 419 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  25 
 
 		 357 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 396 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  26.17 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.15 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  26.17 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  26.87 
 
 		 366 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  22.91 
 
 		 346 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  22.55 
 
 		 352 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  31.25 
 
 		 147 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  27.87 
 
 		 347 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  25.28 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  24.67 
 
 		 349 aa  45.4  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  28.88 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  21.43 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  27.12 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  22.93 
 
 		 390 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  23.81 
 
 		 393 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  27.14 
 
 		 170 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  23.08 
 
 		 350 aa  42  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  26.4 
 
 		 359 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  28.33 
 
 		 156 aa  42  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  23.64 
 
 		 370 aa  42  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>