More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0366 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 128 aa  260  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  42.98 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  53.25 
 
 		 165 aa  87.8  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  49.35 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  42.57 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  38.02 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  37.07 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  36.04 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  32.2 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  45.45 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  40.16 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  30.51 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  46.75 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.54 
 
 		 471 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  36.84 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  31.3 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  28.33 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  39.47 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 479 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 477 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  34.78 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  45.59 
 
 		 477 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 477 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  26.23 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 477 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 477 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  32.43 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  29.37 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>