More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2121 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5341  AMP-dependent synthetase and ligase  50.8 
 
 		 915 aa  768    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  49.08 
 
 		 830 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4142  AMP-dependent synthetase and ligase  47.88 
 
 		 860 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  51.65 
 
 		 889 aa  760    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.813754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1889  AMP-dependent synthetase and ligase  53.57 
 
 		 860 aa  778    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0471823  normal  0.0591915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1979  AMP-dependent synthetase and ligase  49.2 
 
 		 830 aa  695    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2121  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 868 aa  1733    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5747  AMP-dependent synthetase and ligase  48.17 
 
 		 831 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2025  AMP-dependent synthetase and ligase  49.2 
 
 		 830 aa  695    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2855  AMP-dependent synthetase and ligase  48.57 
 
 		 829 aa  683    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  47.38 
 
 		 862 aa  635  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0560008  normal  0.885424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2019  AMP-dependent synthetase and ligase  46.45 
 
 		 841 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00459182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0772  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 		 887 aa  446  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0989084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2621  AMP-dependent synthetase and ligase  40.74 
 
 		 453 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2512  AMP-dependent synthetase and ligase  39.18 
 
 		 460 aa  292  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.280527  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2843  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 		 459 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0145799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3177  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 471 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 497 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  39.94 
 
 		 534 aa  194  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  42.37 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 523 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  41.58 
 
 		 523 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 490 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 517 aa  174  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 418 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 520 aa  168  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 520 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 526 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 521 aa  159  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  26.31 
 
 		 923 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 505 aa  146  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  37.37 
 
 		 514 aa  146  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 505 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 505 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 523 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 519 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.64 
 
 		 514 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3152  amino acid adenylation domain-containing protein  27.41 
 
 		 923 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 529 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 538 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.56 
 
 		 492 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  27.64 
 
 		 923 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 523 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  36.15 
 
 		 515 aa  134  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  31.91 
 
 		 8211 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.04 
 
 		 512 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 512 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  36.03 
 
 		 529 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 531 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 533 aa  129  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  29.77 
 
 		 536 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  28.7 
 
 		 1137 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 529 aa  125  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  30.21 
 
 		 2187 aa  125  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 529 aa  125  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0888  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.41 
 
 		 1152 aa  124  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.28 
 
 		 530 aa  124  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 526 aa  121  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 		 510 aa  121  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 538 aa  121  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.79 
 
 		 491 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 		 509 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  29.83 
 
 		 5467 aa  120  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  29.24 
 
 		 1332 aa  119  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 513 aa  119  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 509 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 535 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 535 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1923  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.93 
 
 		 1150 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 535 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 608 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 524 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 535 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 691 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.2 
 
 		 3639 aa  118  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  33.33 
 
 		 539 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 522 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.08 
 
 		 510 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 545 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 524 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 585 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  32.45 
 
 		 522 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  31.78 
 
 		 522 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.85 
 
 		 510 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 510 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  33.33 
 
 		 519 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 522 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  29.34 
 
 		 2201 aa  114  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  27.79 
 
 		 492 aa  114  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.12 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  30.67 
 
 		 532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  27.99 
 
 		 5750 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 583 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>