More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2078 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  73.39 
 
 		 126 aa  170  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  46.55 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  50.48 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  44.64 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  44.83 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  49.53 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  46.49 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  46.73 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 119 aa  84.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  40.65 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  57.97 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  57.14 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  52.63 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  47.66 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  43.4 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  56.72 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  46.99 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  51.47 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 480 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  52.86 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 481 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  39.24 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 465 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  31.36 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  31.36 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  30.97 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  42.65 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.76 
 
 		 488 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  50 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 432 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  50.72 
 
 		 434 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 547 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  36.84 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.89 
 
 		 593 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0668  regulatory protein GntR HTH  48.11 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000391689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.62 
 
 		 468 aa  57.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 482 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  40.54 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  28.57 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  40.54 
 
 		 483 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>