More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1995 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 359 aa  741    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  48.49 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  47.76 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  44.81 
 
 		 824 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  45.57 
 
 		 810 aa  256  4e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  42.59 
 
 		 812 aa  256  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  45.11 
 
 		 809 aa  250  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  42.51 
 
 		 809 aa  250  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  45.1 
 
 		 788 aa  243  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  40.8 
 
 		 781 aa  239  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  40.98 
 
 		 782 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  39.53 
 
 		 779 aa  236  5.0000000000000005e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  40.41 
 
 		 891 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  41.27 
 
 		 761 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  41.51 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  39.68 
 
 		 794 aa  227  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  35.97 
 
 		 758 aa  226  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  42.07 
 
 		 785 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  37.65 
 
 		 754 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40.81 
 
 		 761 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  38.6 
 
 		 764 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  41.72 
 
 		 971 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  35.69 
 
 		 758 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 		 758 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  43.37 
 
 		 907 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.74 
 
 		 891 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  37.07 
 
 		 890 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  39.05 
 
 		 762 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  35.69 
 
 		 758 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  41.75 
 
 		 785 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  40.92 
 
 		 789 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  38.44 
 
 		 760 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  40.95 
 
 		 780 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  40.41 
 
 		 791 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  40.62 
 
 		 789 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  40.62 
 
 		 789 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  40.31 
 
 		 789 aa  215  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 		 799 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  40.31 
 
 		 789 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  39.49 
 
 		 868 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 789 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  39.47 
 
 		 815 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 789 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 789 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  40.81 
 
 		 769 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  40.49 
 
 		 791 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  38.2 
 
 		 868 aa  212  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  38.2 
 
 		 868 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  38.2 
 
 		 868 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  39.63 
 
 		 791 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  40.61 
 
 		 790 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  40.55 
 
 		 808 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  38.84 
 
 		 790 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  36.89 
 
 		 758 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  36.97 
 
 		 758 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  38.2 
 
 		 869 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  39.81 
 
 		 805 aa  210  3e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  41.1 
 
 		 791 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  39.33 
 
 		 795 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  39.07 
 
 		 795 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  38.03 
 
 		 792 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  38.19 
 
 		 762 aa  209  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.13 
 
 		 810 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  39.88 
 
 		 791 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 800 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  39.7 
 
 		 791 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  41.1 
 
 		 792 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  40.18 
 
 		 791 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  39.7 
 
 		 791 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  39 
 
 		 790 aa  209  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  39.76 
 
 		 789 aa  208  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.94 
 
 		 902 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.99 
 
 		 869 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  44.26 
 
 		 835 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 791 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  37.14 
 
 		 757 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 		 809 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 		 868 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  39.81 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  37.25 
 
 		 760 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  37.62 
 
 		 758 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 		 789 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  39.49 
 
 		 868 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  38.21 
 
 		 798 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  39.71 
 
 		 796 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  39.7 
 
 		 810 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  39.02 
 
 		 789 aa  206  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 		 787 aa  205  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.18 
 
 		 903 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  38.53 
 
 		 790 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.72 
 
 		 852 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  37.92 
 
 		 792 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  39.09 
 
 		 778 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  38.79 
 
 		 790 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  36.68 
 
 		 804 aa  203  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  38.41 
 
 		 790 aa  203  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.35 
 
 		 873 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  38.11 
 
 		 819 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  36.06 
 
 		 812 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 		 832 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>