More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1835 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1835  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 336 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3194  LacI family transcription regulator  50.76 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0448  LacI family transcription regulator  42.72 
 
 		 328 aa  242  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3739  regulatory protein LacI  38.19 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160393  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0052  transcriptional regulator, LacI family  39.22 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2415  transcriptional regulator, LacI family  32.95 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.80536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  31.21 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4766  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.55 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  29.45 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2529  regulatory protein LacI  30.98 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  30.22 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 		 335 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  31.05 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3835  LacI family transcription regulator  29.93 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3909  LacI family transcription regulator  29.93 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  28.16 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.25 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.95 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.3 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  30.69 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  25.99 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.91 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2386  LacI family transcription regulator  29.93 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737452  normal  0.472555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.35 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  28.36 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.36 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.77 
 
 		 342 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3821  LacI family transcription regulator  29.59 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215608  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  29.9 
 
 		 663 aa  89.4  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.57 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.59 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  29.12 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1459  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 340 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  29.49 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  30.46 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  28.29 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  28.33 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  28.33 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  28.33 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  28.67 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  29.61 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4618  regulatory protein LacI  29.11 
 
 		 332 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  28.67 
 
 		 332 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  27.9 
 
 		 338 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  28.73 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  31.94 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1012  transcriptional regulator, LacI family  30.24 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.03718  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.93 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 347 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 366 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0795  LacI family transcription regulator  26.27 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3367  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  27 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  27.99 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.95 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  28.33 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  27.99 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6854  transcriptional regulator, LacI family  29.76 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000835434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0385  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.46 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  28.22 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  27.87 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.67 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.95 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.39 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  27.68 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>