More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0579 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0579  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  739    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0257  oxidoreductase domain protein  71.55 
 
 
367 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1373  oxidoreductase domain protein  48.27 
 
 
338 aa  259  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  33.54 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  42.03 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  33.82 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  34.19 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  35.83 
 
 
347 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  34.81 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  37.93 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.21 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  32.21 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  30.34 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.9 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  35.58 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.3 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  22.84 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  36.62 
 
 
340 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  30.22 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.22 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  30.22 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  37.98 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  32.74 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  30.68 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  35.43 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  34.68 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  36.09 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  36.15 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  34.51 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 
715 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.06 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  34.38 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  40 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  35.38 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.29 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  34.12 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  33.59 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  39.25 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  34.81 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  35.22 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  36.72 
 
 
347 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  33.75 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  34.81 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.11 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 
368 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  34.81 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  38.13 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 
328 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  34.81 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  39.42 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  34.11 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 
371 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.08 
 
 
353 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.93 
 
 
353 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  32.6 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 
352 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.89 
 
 
353 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  34.74 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.47 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.15 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.22 
 
 
312 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  34.36 
 
 
348 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.47 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.58 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.47 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  34.74 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  25.18 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  29.91 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  27.27 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 
359 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
348 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 
377 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
719 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  30.14 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>