268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0334 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
159 aa  320  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  85.26 
 
 
159 aa  250  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  74.68 
 
 
159 aa  241  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  73.25 
 
 
159 aa  234  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  60.27 
 
 
162 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  59.59 
 
 
162 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  59.59 
 
 
162 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  58.62 
 
 
167 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  60.14 
 
 
176 aa  169  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  58.62 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  58.62 
 
 
162 aa  164  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  50.67 
 
 
170 aa  144  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  42.96 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  44.44 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  42.96 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  39.86 
 
 
155 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  40.58 
 
 
158 aa  103  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  38.41 
 
 
149 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  42.15 
 
 
162 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  40.5 
 
 
155 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  37.31 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  38.06 
 
 
155 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  33.57 
 
 
222 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  32.45 
 
 
182 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  34.53 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  32.43 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  31.17 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  31.17 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  31.17 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.85 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  31.65 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  32.62 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.82 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.85 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  28.47 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  31.79 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.85 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  33.88 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  32.37 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  30.94 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  29.73 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  30.71 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4674  Ferritin Dps family protein  32.67 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  31.5 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  35.71 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.21 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  29.2 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  32.5 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  31.85 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  33.1 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  29.61 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  31.21 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.14 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  31.3 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  30.99 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  30.99 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.56 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  28.99 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  30.99 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4661  Ferritin Dps family protein  31.13 
 
 
196 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  29.71 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5629  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000821528  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2003  Ferritin Dps family protein  31.45 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.97873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  28.99 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  29.79 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.83 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.83 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.83 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.2 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  29.08 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  28.99 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  31.65 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  28.99 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  28.77 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  28.78 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  28.77 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  28.77 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  29.79 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  28.15 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  30.94 
 
 
201 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  29.79 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  29.08 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  30.94 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  29.08 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  29.08 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  29.08 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  29.08 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  29.08 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  29.93 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5237  Ferritin Dps family protein  29.75 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  29.93 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.93 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  29.5 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>