43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0056 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0056  thymidylate kinase  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3422  thymidylate kinase  56.28 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2353  thymidylate kinase  36.04 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3961  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057611  normal  0.564595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3581  thymidylate kinase  33.97 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  25.63 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  24.39 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  28.79 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  25.97 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  26.2 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  27.27 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  32.77 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2395  hypothetical protein  28.44 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  28.34 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3363  hypothetical protein  28.44 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.787828  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  28.21 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  25.13 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  27.1 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  28.21 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  29.89 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  29.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  27.32 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0020  thymidylate kinase  22.75 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  27.19 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  26.57 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  24.85 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  26.54 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  24.61 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2513  Thymidylate kinase-like protein  26.62 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0067  deoxyguanosine kinase/deoxyadenosine kinase  32.29 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  29.03 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  23.62 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0070  deoxynucleoside kinase family protein  32.29 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  23.65 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  31.14 
 
 		 213 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2229  adenylate kinase  24.7 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568748  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  25.12 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2162  thymidylate kinase  26.14 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>