243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0999 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  49.72 
 
 
185 aa  187  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  50.91 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  50.55 
 
 
192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  49.38 
 
 
187 aa  171  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  49.38 
 
 
208 aa  171  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  44.71 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  45.16 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  44.86 
 
 
184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  43.88 
 
 
202 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  46.99 
 
 
186 aa  158  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  41.8 
 
 
212 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  45.68 
 
 
184 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  44.51 
 
 
186 aa  144  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  43.65 
 
 
196 aa  144  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  38.98 
 
 
183 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  40 
 
 
193 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  41.8 
 
 
217 aa  141  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  42.51 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  42.77 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  40.21 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  40.85 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  38.86 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  41.82 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  45.09 
 
 
194 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  39.01 
 
 
184 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  38.81 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  43.02 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  40.84 
 
 
194 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  38.67 
 
 
184 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  39.9 
 
 
198 aa  134  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  38.59 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  39.44 
 
 
183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  41.92 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  40.1 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  41.86 
 
 
188 aa  132  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  39.39 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  40.1 
 
 
215 aa  131  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  39.68 
 
 
220 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  38.02 
 
 
194 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  37.78 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  38 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  43.75 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  42.31 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  38.42 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  42.17 
 
 
181 aa  129  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  36.9 
 
 
186 aa  128  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  42.31 
 
 
183 aa  128  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  36.67 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  43.1 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  39.63 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  39.68 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  38.74 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  38.55 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  39.68 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  41.14 
 
 
244 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  36.98 
 
 
211 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  36.98 
 
 
211 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  41.38 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  41.38 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  43.14 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  41.14 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  41.38 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  41.14 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  41.38 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  41.38 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  41.38 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  41.38 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  36.87 
 
 
198 aa  125  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  38.69 
 
 
203 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  37.5 
 
 
211 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  43.14 
 
 
208 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  42.94 
 
 
192 aa  124  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  35.57 
 
 
197 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  37.78 
 
 
183 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  37.78 
 
 
183 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  39.31 
 
 
194 aa  124  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  40.31 
 
 
208 aa  124  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  38.02 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  39.2 
 
 
208 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  41.62 
 
 
194 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  40.23 
 
 
222 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  35.59 
 
 
184 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  38.51 
 
 
196 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  39.43 
 
 
196 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  40.12 
 
 
249 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  37.78 
 
 
186 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  40.91 
 
 
197 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  35 
 
 
181 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  42.01 
 
 
200 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  40.46 
 
 
194 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  36.6 
 
 
195 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  39.79 
 
 
212 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  37.89 
 
 
194 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  39.51 
 
 
180 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  41.38 
 
 
220 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  44.52 
 
 
188 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>