More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0460 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1140  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 398 aa  807    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000136434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0460  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 398 aa  807    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  72.11 
 
 		 395 aa  594  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 399 aa  589  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  70.28 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  70.28 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  69.46 
 
 		 405 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  69.46 
 
 		 405 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  69.5 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  69.58 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  70.2 
 
 		 405 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  69.5 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  68.5 
 
 		 399 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  70.2 
 
 		 405 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 400 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  69.25 
 
 		 400 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  69.9 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  68.5 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  69.9 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  70.1 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  70.1 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 394 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  68.26 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 394 aa  568  1e-161  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  68.84 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  69.6 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  69.6 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  68.98 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  69.1 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  67.92 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  68.84 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 400 aa  568  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 394 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  69.11 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 391 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 391 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  67.33 
 
 		 400 aa  567  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  72.11 
 
 		 395 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  68.84 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  68.84 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  69.15 
 
 		 400 aa  565  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  69.15 
 
 		 400 aa  565  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  67.33 
 
 		 400 aa  567  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  68.42 
 
 		 396 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0495  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0610373  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  68.42 
 
 		 396 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  67.59 
 
 		 396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  68.51 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 395 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0483  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000918892  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  68.34 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>