More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2084 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
390 aa  818    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0044  glycosyltransferase  27.27 
 
 
353 aa  122  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
388 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  27.74 
 
 
365 aa  119  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
365 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  26.58 
 
 
440 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  29 
 
 
416 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
808 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4707  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.103608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
890 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
390 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
678 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
660 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
396 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
669 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
762 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  27.68 
 
 
435 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  26.81 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
819 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
812 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  25.1 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  24.7 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
392 aa  77  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  23.88 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3396  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  25.46 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1956  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.34 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.38 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.38 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.61 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
388 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  23.93 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.5 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  26.13 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13801  hypothetical protein  26.26 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.8447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1209  putative glycosyltransferase  26.39 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.68 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.68 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  27.24 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1026  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.87 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.87 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>