More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6065 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 259 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.47 
 
 		 262 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  71.04 
 
 		 259 aa  358  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.41 
 
 		 262 aa  346  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 		 288 aa  344  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.48 
 
 		 257 aa  321  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.09 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  63.71 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  61.63 
 
 		 268 aa  316  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.57 
 
 		 257 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.2 
 
 		 261 aa  308  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  63.39 
 
 		 258 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  61.83 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.91 
 
 		 259 aa  291  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.92 
 
 		 257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.16 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.54 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.37 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  48.36 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  47.95 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13055  enoyl-CoA hydratase  53.24 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.43 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  48.74 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  48.81 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  48.81 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  48.81 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  47.54 
 
 		 258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.53 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.62 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  48.36 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.21 
 
 		 260 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.53 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  48.33 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5078  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.06 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  48.1 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1905  enoyl-CoA hydratase  52.71 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.888285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1839  enoyl-CoA hydratase  52.71 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.71 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  44.67 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.67 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  47.48 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.2 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.27 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.49 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  44.23 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.19 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  44.81 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.21 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.21 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.21 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.9 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.72 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.35 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.32 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2089  enoyl-CoA hydratase  53 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  46.5 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  43.98 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  44.03 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  42.5 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  42.5 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.98 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.5 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>