243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5802 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 284 aa  554  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  35.87 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  33.5 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 262 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 242 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  30.59 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  32.26 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  30.2 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  33.15 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  31.02 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  29.64 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  25.54 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  37.35 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  31.75 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 166 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 141 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 141 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 141 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  37.31 
 
 		 128 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  42.25 
 
 		 155 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  41.43 
 
 		 144 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 148 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 150 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 183 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 		 148 aa  50.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  35.82 
 
 		 128 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 144 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 129 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 143 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 134 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 144 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2870  transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 119 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 131 aa  48.9  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 120 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 136 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 132 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  34.78 
 
 		 130 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>