63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4265 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  100 
 
 		 1178 aa  2299    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  46.24 
 
 		 1055 aa  452  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  42.44 
 
 		 1216 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  43.46 
 
 		 1314 aa  376  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  40.72 
 
 		 1127 aa  365  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  39.09 
 
 		 1104 aa  361  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  42.3 
 
 		 1099 aa  355  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  44.21 
 
 		 971 aa  339  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  42.14 
 
 		 1083 aa  337  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  39.73 
 
 		 1130 aa  335  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  39.01 
 
 		 1116 aa  313  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  39.64 
 
 		 1086 aa  310  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  37.57 
 
 		 1422 aa  292  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  45.29 
 
 		 1012 aa  290  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1001 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  36.06 
 
 		 963 aa  279  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  35.55 
 
 		 1264 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  35.62 
 
 		 1264 aa  275  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  35.6 
 
 		 1264 aa  273  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  35.35 
 
 		 1264 aa  272  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  35.86 
 
 		 1262 aa  271  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  38.8 
 
 		 988 aa  254  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  34.17 
 
 		 1125 aa  246  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  36.09 
 
 		 1086 aa  243  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1210 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1210 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  35.1 
 
 		 1329 aa  240  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  32.45 
 
 		 1220 aa  238  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  31.52 
 
 		 1210 aa  235  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  38.76 
 
 		 1291 aa  234  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  31.64 
 
 		 1210 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  31.64 
 
 		 1210 aa  232  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  31.58 
 
 		 1209 aa  228  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  38.34 
 
 		 1297 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  28.83 
 
 		 1137 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  26.42 
 
 		 1146 aa  128  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.45 
 
 		 1139 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1139 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.2 
 
 		 1275 aa  119  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1139 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  28.49 
 
 		 1139 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1108 aa  107  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1249 aa  105  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  24.49 
 
 		 465 aa  97.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  22.44 
 
 		 1094 aa  94.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  18.94 
 
 		 903 aa  89.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  23.9 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  24.53 
 
 		 857 aa  80.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  22.22 
 
 		 789 aa  79.3  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  22.64 
 
 		 800 aa  79.3  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  29.72 
 
 		 811 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  21.74 
 
 		 898 aa  73.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.44 
 
 		 852 aa  72  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  23.82 
 
 		 634 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  28.7 
 
 		 837 aa  66.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  22.3 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  21 
 
 		 762 aa  63.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  25.83 
 
 		 817 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  27.41 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  23.68 
 
 		 862 aa  54.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  21.02 
 
 		 739 aa  53.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  23.76 
 
 		 862 aa  51.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0415  multiple banded antigen  45.88 
 
 		 423 aa  48.5  0.0008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>