More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3667 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3667  ABC transporter related  100 
 
 		 617 aa  1189    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4037  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 591 aa  320  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.073685  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2777  ABC transporter related  38.98 
 
 		 608 aa  317  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.784586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7440  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3689  ABC transporter related  37.48 
 
 		 637 aa  313  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1772  hypothetical protein  41.71 
 
 		 575 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3109  ABC transporter related protein  43.73 
 
 		 590 aa  306  8.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.516778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  42.74 
 
 		 595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4862  ABC transporter related  41 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 616 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1142  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  40.08 
 
 		 578 aa  293  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2983  ABC transporter related  35.13 
 
 		 653 aa  286  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4953  ABC transporter related  39.18 
 
 		 683 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.84 
 
 		 579 aa  270  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.56 
 
 		 626 aa  269  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320333  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5093  ABC transporter related protein  36.01 
 
 		 597 aa  264  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.390204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0007  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1968  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 619 aa  251  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.09 
 
 		 586 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.92 
 
 		 586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.09 
 
 		 586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  29.89 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.92 
 
 		 586 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 586 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  28.06 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  27.8 
 
 		 583 aa  238  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.3 
 
 		 586 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.3 
 
 		 586 aa  237  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.56 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  29.25 
 
 		 586 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  28.79 
 
 		 616 aa  233  8.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.37 
 
 		 628 aa  230  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  32.6 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.57 
 
 		 580 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.41 
 
 		 586 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.43 
 
 		 597 aa  228  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  32.77 
 
 		 645 aa  227  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  31.99 
 
 		 582 aa  227  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.9 
 
 		 596 aa  226  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.53 
 
 		 617 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.86 
 
 		 600 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.31 
 
 		 556 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.11 
 
 		 595 aa  223  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  34.3 
 
 		 576 aa  223  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  34.58 
 
 		 611 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  29.23 
 
 		 582 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  32.86 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.43 
 
 		 606 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.39 
 
 		 619 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.06 
 
 		 580 aa  221  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.68 
 
 		 575 aa  220  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  30.24 
 
 		 589 aa  220  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.26 
 
 		 597 aa  220  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  27.25 
 
 		 577 aa  220  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.26 
 
 		 597 aa  220  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2418  ABC transporter related  31.73 
 
 		 585 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  29.22 
 
 		 573 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.47 
 
 		 616 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.91 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  27.01 
 
 		 614 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  29.53 
 
 		 613 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.3 
 
 		 644 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.4 
 
 		 615 aa  218  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  31.3 
 
 		 634 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.42 
 
 		 571 aa  218  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  33.14 
 
 		 672 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  29.96 
 
 		 669 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  28.41 
 
 		 672 aa  217  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  30.6 
 
 		 567 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.92 
 
 		 613 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.11 
 
 		 644 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.91 
 
 		 567 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.11 
 
 		 634 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.05 
 
 		 620 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  30.63 
 
 		 653 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.97 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.73 
 
 		 613 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.42 
 
 		 606 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.4 
 
 		 618 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29.41 
 
 		 572 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  29.76 
 
 		 615 aa  215  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  30.43 
 
 		 566 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.52 
 
 		 601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.6 
 
 		 580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.51 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  30.38 
 
 		 623 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  27.27 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  31.46 
 
 		 585 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  26.71 
 
 		 607 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  26.91 
 
 		 671 aa  214  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  27.15 
 
 		 580 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0093  ABC transporter related protein  32.39 
 
 		 606 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  29.15 
 
 		 601 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  34.47 
 
 		 606 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.3 
 
 		 613 aa  213  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.37 
 
 		 586 aa  213  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  28.92 
 
 		 640 aa  213  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.16 
 
 		 611 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  26.81 
 
 		 575 aa  213  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  29.39 
 
 		 606 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>