More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0093 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0093  ABC transporter related protein  100 
 
 
606 aa  1174    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.44 
 
 
626 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320333  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0007  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.15 
 
 
586 aa  316  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.98 
 
 
586 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.8 
 
 
586 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 
586 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
586 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.86 
 
 
586 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.86 
 
 
586 aa  310  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  32.75 
 
 
586 aa  306  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1142  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  38.79 
 
 
578 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  32.43 
 
 
583 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3109  ABC transporter related protein  41.21 
 
 
590 aa  301  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.516778  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  39.14 
 
 
595 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1772  hypothetical protein  38.78 
 
 
575 aa  294  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7440  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
620 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
598 aa  292  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2983  ABC transporter related  36.12 
 
 
653 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4037  ABC transporter related protein  36.17 
 
 
591 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.073685  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  34.23 
 
 
623 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1345  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.05 
 
 
599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0100192  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.27 
 
 
575 aa  274  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  31.72 
 
 
573 aa  274  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2777  ABC transporter related  35.23 
 
 
608 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.784586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  34.01 
 
 
616 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3689  ABC transporter related  34.77 
 
 
637 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4953  ABC transporter related  36.39 
 
 
683 aa  265  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539939  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1968  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
619 aa  258  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153822  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.11 
 
 
600 aa  257  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.17 
 
 
606 aa  257  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  30.58 
 
 
575 aa  256  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  30.58 
 
 
575 aa  256  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  32.29 
 
 
597 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1815  ABC transporter  38.83 
 
 
370 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.36 
 
 
586 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  30.19 
 
 
645 aa  254  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.05 
 
 
641 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.81 
 
 
632 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.27 
 
 
606 aa  253  7e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.39 
 
 
627 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.83 
 
 
639 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  28.64 
 
 
646 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.04 
 
 
634 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  31.24 
 
 
600 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  31.64 
 
 
598 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.85 
 
 
608 aa  250  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.06 
 
 
628 aa  250  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.54 
 
 
579 aa  249  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  29.91 
 
 
620 aa  249  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  28.39 
 
 
607 aa  249  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  30 
 
 
631 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.29 
 
 
582 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.03 
 
 
677 aa  248  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.21 
 
 
650 aa  248  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  31.9 
 
 
601 aa  247  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  28.31 
 
 
626 aa  247  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.12 
 
 
620 aa  246  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  29.8 
 
 
613 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  32.56 
 
 
586 aa  246  8e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  28.25 
 
 
598 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  31.09 
 
 
586 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  31.56 
 
 
601 aa  244  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.07 
 
 
594 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.84 
 
 
597 aa  243  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  30.73 
 
 
586 aa  243  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  31.53 
 
 
596 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.81 
 
 
578 aa  243  7e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  31.95 
 
 
619 aa  243  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4862  ABC transporter related  35.34 
 
 
599 aa  243  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.95 
 
 
634 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.18 
 
 
644 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.82 
 
 
613 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  28.24 
 
 
628 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.44 
 
 
590 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  31.95 
 
 
671 aa  243  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.56 
 
 
606 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.88 
 
 
597 aa  243  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  29.13 
 
 
578 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.2 
 
 
589 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  29.13 
 
 
578 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.94 
 
 
613 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.88 
 
 
597 aa  242  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.01 
 
 
634 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.85 
 
 
580 aa  241  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.71 
 
 
644 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 
629 aa  240  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.49 
 
 
637 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.3 
 
 
616 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.8 
 
 
619 aa  239  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.9 
 
 
586 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.03 
 
 
593 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.85 
 
 
618 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.99 
 
 
601 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  29.31 
 
 
623 aa  238  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.43 
 
 
615 aa  238  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  31.72 
 
 
669 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.55 
 
 
595 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  33.9 
 
 
606 aa  237  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  28.69 
 
 
600 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>