More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2777 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2777  ABC transporter related  100 
 
 		 608 aa  1164    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.784586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  61.8 
 
 		 616 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5093  ABC transporter related protein  65.25 
 
 		 597 aa  672    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.390204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4862  ABC transporter related  63.45 
 
 		 599 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3689  ABC transporter related  52.43 
 
 		 637 aa  589  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1968  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 619 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1772  hypothetical protein  46.38 
 
 		 575 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7440  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 620 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3109  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 590 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.516778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4037  ABC transporter related protein  42.33 
 
 		 591 aa  363  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.073685  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  44.13 
 
 		 595 aa  344  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1142  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  41.74 
 
 		 578 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3667  ABC transporter related  39.07 
 
 		 617 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2983  ABC transporter related  37.62 
 
 		 653 aa  317  5e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.29 
 
 		 626 aa  301  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320333  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0007  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 588 aa  300  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.12 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.24 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.43 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.61 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.61 
 
 		 586 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  31.25 
 
 		 586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.43 
 
 		 586 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.26 
 
 		 586 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4953  ABC transporter related  36 
 
 		 683 aa  273  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  30.73 
 
 		 583 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  30.51 
 
 		 573 aa  257  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0093  ABC transporter related protein  35.23 
 
 		 606 aa  256  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  30.42 
 
 		 600 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.25 
 
 		 571 aa  248  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  33.81 
 
 		 623 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  31.06 
 
 		 597 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  32.37 
 
 		 603 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.66 
 
 		 597 aa  242  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.39 
 
 		 650 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.49 
 
 		 597 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.11 
 
 		 575 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.55 
 
 		 571 aa  239  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.91 
 
 		 556 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.55 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.55 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.55 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1345  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.78 
 
 		 599 aa  239  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0100192  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.21 
 
 		 575 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.73 
 
 		 579 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.32 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.86 
 
 		 587 aa  239  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.55 
 
 		 571 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.88 
 
 		 584 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  27.23 
 
 		 607 aa  237  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  30.95 
 
 		 814 aa  237  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  31.64 
 
 		 627 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  30.95 
 
 		 768 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  28.37 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.37 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.37 
 
 		 571 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.88 
 
 		 768 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  35.16 
 
 		 634 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  32.31 
 
 		 610 aa  233  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  27.71 
 
 		 575 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  27.71 
 
 		 575 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.35 
 
 		 625 aa  233  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  29.9 
 
 		 610 aa  233  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3252  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.7 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.78 
 
 		 619 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  29.9 
 
 		 598 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  29.73 
 
 		 589 aa  231  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.95 
 
 		 580 aa  231  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  26.38 
 
 		 597 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.28 
 
 		 572 aa  230  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  29.47 
 
 		 582 aa  230  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  33.22 
 
 		 600 aa  230  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.55 
 
 		 608 aa  229  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  28.99 
 
 		 612 aa  229  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.87 
 
 		 625 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  28.95 
 
 		 572 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  26.53 
 
 		 628 aa  229  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  34.46 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  27.1 
 
 		 580 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  28.85 
 
 		 597 aa  228  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.41 
 
 		 580 aa  227  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  31.51 
 
 		 582 aa  227  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  28.3 
 
 		 575 aa  227  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.06 
 
 		 628 aa  227  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  28.75 
 
 		 572 aa  227  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  28.75 
 
 		 572 aa  227  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.1 
 
 		 591 aa  226  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  31.29 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  27.95 
 
 		 631 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.02 
 
 		 606 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  31.78 
 
 		 595 aa  225  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.46 
 
 		 764 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  28.77 
 
 		 596 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.53 
 
 		 637 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  31.71 
 
 		 601 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.25 
 
 		 585 aa  223  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.02 
 
 		 590 aa  223  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 628 aa  223  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1985  ABC transporter related  32.59 
 
 		 597 aa  223  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.384542  normal  0.0512994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>