More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4306 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  100 
 
 		 355 aa  714    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  87.04 
 
 		 349 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  87.04 
 
 		 349 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2256  parB-like partition protein  64.17 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  58.12 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  32.48 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  36.89 
 
 		 378 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  40.22 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5811  parB-like partition protein  34.95 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  27.73 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  34.9 
 
 		 293 aa  90.5  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  30.73 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  36.96 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  35.95 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  35.68 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  34.54 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  32.31 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  30.89 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  32.97 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  34.85 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  29.52 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  32.07 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  32.2 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  32.02 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  29.52 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  31.52 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  35.75 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  35.26 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  37.04 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  33.86 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  34.38 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  34.92 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  36.13 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  34.01 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  34.39 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  31.66 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  34.62 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  32.65 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  32.29 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  33.12 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  32.8 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  35.1 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  32.8 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  31.61 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  34.19 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  34.72 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  33.33 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  34.36 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  35.06 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  32.32 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  33.16 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  32.42 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.32 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  33.51 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  32.29 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  30.84 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  32.81 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  32.81 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  32.81 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  32.81 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  32.81 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  32.81 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  32.81 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  32.81 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  31.18 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  33.51 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  33 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  32.29 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 292 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  32.29 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  32.29 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  32.29 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  32 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  32.29 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  34.2 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  33.11 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  32.12 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  31.13 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  36.81 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  32.29 
 
 		 295 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  30.05 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  34.94 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.74 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  31.13 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  27.95 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  31.13 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  33.55 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  31.53 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  31.72 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>