61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3937 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  98.42 
 
 
317 aa  636    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  100 
 
 
317 aa  648    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  63.41 
 
 
316 aa  407  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  61.83 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  30.72 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  29.47 
 
 
375 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  29.02 
 
 
375 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  29 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  29.22 
 
 
393 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  29 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  29 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  28.02 
 
 
379 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  28.7 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  28.7 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  28.7 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  28.7 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  27.12 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  27.83 
 
 
630 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  25.29 
 
 
403 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  26.37 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  29.11 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  26.53 
 
 
597 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  28.16 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  26.77 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  27.22 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  26.19 
 
 
597 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  30.33 
 
 
647 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.81 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  27.81 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  27.53 
 
 
594 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.5 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0368  hypothetical protein  25.89 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000377368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0298  hypothetical protein  24.4 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784085  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.16 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.16 
 
 
378 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0696  putative lipase / esterase  24.75 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.082644  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  26.19 
 
 
340 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  22.08 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  24.93 
 
 
640 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  26.36 
 
 
640 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.29 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  23.78 
 
 
628 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.51 
 
 
617 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  24.05 
 
 
628 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  24.76 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  25.08 
 
 
309 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  29.79 
 
 
584 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  30.16 
 
 
656 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  23.3 
 
 
626 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0193  hypothetical protein  26.11 
 
 
663 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  29.63 
 
 
656 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  24.02 
 
 
636 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  24.14 
 
 
629 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3287  lipolytic protein G-D-S-L family  24.51 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359649  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  29.63 
 
 
656 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.92 
 
 
723 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  20.82 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  23.85 
 
 
629 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4567  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  23.64 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  23.01 
 
 
288 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  23.12 
 
 
629 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>