17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0368 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0368  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000377368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0298  hypothetical protein  31.27 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784085  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  24.84 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  25.16 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  25.16 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  27.27 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  26.62 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  30.87 
 
 		 379 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  27.09 
 
 		 393 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  28.45 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  28.45 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  28.45 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  28.45 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  28.45 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  28.45 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  28.45 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.11 
 
 		 375 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>