More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3178 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  74.18 
 
 		 485 aa  722    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  100 
 
 		 493 aa  993    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  92.71 
 
 		 496 aa  903    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2806  cobyric acid synthase CobQ  72.2 
 
 		 501 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563114  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  72.91 
 
 		 494 aa  706    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1552  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  81.67 
 
 		 492 aa  770    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.333423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  77.27 
 
 		 479 aa  728    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  72.08 
 
 		 507 aa  711    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  80.34 
 
 		 628 aa  670    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2304  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  64.61 
 
 		 508 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016218  normal  0.711667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2661  cobyric acid synthase CobQ  65.29 
 
 		 513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0518  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  55.89 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00186499  normal  0.0297746 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  55.46 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  44.13 
 
 		 476 aa  349  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  47.81 
 
 		 521 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.75 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  43.32 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.66 
 
 		 517 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  39.32 
 
 		 513 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  46.83 
 
 		 527 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.76 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  42.91 
 
 		 483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  46.14 
 
 		 575 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.37 
 
 		 491 aa  335  9e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  45.2 
 
 		 863 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  45.68 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  39.96 
 
 		 514 aa  333  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  45.71 
 
 		 494 aa  332  9e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  47.16 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  45.51 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  44.52 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.39 
 
 		 506 aa  329  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.74 
 
 		 506 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.17 
 
 		 506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  41.96 
 
 		 506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  42.12 
 
 		 858 aa  326  5e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  41.74 
 
 		 513 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  40.83 
 
 		 488 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  42.76 
 
 		 514 aa  325  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  42.37 
 
 		 515 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.47 
 
 		 490 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  42.57 
 
 		 494 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  38.77 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  44.25 
 
 		 490 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  47.03 
 
 		 490 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  45.07 
 
 		 491 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  42.05 
 
 		 491 aa  319  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  44.25 
 
 		 491 aa  319  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  40.69 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  40.69 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  40.57 
 
 		 491 aa  318  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  43.04 
 
 		 852 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  44.64 
 
 		 863 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  45.9 
 
 		 496 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  40.86 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  45.86 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  42.08 
 
 		 864 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  40.24 
 
 		 797 aa  316  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  41.35 
 
 		 539 aa  316  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  41.09 
 
 		 495 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  42.27 
 
 		 495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  37 
 
 		 487 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  49.51 
 
 		 501 aa  312  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.39 
 
 		 486 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  42.42 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  42.06 
 
 		 496 aa  312  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  42.95 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  37 
 
 		 487 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  40.08 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  42.98 
 
 		 485 aa  310  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 551 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  40.98 
 
 		 488 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  42.15 
 
 		 529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  40.75 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  42.95 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  41.67 
 
 		 507 aa  306  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  39.76 
 
 		 511 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  42.89 
 
 		 484 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  41.83 
 
 		 484 aa  306  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  37.48 
 
 		 526 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  40.78 
 
 		 484 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  43.2 
 
 		 511 aa  305  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  42.03 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  40.17 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  37.5 
 
 		 565 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  43.64 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  38.08 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  38.7 
 
 		 534 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  43.26 
 
 		 495 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  43.56 
 
 		 512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0061  cobyric acid synthase CobQ  42.42 
 
 		 954 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 483 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  39.92 
 
 		 502 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  40.38 
 
 		 512 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  38.72 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  38.83 
 
 		 536 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  42.29 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  37.96 
 
 		 560 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  40.74 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  37.19 
 
 		 556 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>