38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1883 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  86.24 
 
 		 109 aa  187  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  63.81 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  58.89 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  64.2 
 
 		 277 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  56.67 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  48.75 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  35.64 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  37.66 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  30.61 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3466  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  33.73 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0038  hypothetical protein  32.56 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.203606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>