More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0714 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0714  ribonuclease H  100 
 
 		 148 aa  296  5e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  55.07 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0418  ribonuclease H  53.96 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  48.98 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  51.8 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  50.71 
 
 		 159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  48.89 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  48.59 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  46.9 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  45.58 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0160  ribonuclease H  50.76 
 
 		 191 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  46.48 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  46.48 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  44.22 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  43.54 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  46.21 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  48.15 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  48.28 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  44.6 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  46.21 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  44.83 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  44.83 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  45.99 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  46.32 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  45.65 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  46.71 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  48.55 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  46.15 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  43.26 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  50.68 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  43.07 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  43.24 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  47.76 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  46.85 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  50.36 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  40.85 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  45.14 
 
 		 170 aa  110  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  45.52 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  41.38 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  45.45 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  45.45 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  45.45 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  45.45 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  44.29 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  46.38 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  45.45 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  45.45 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  45.45 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  46.85 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  47.1 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  42.57 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  41.78 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  44.76 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  44.68 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  45.89 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  47.26 
 
 		 235 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  44.44 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  45 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  41.38 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  47.48 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  44.37 
 
 		 259 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  44.37 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  43.26 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  41.96 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  50.74 
 
 		 228 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  47.1 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  50.74 
 
 		 228 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  44.06 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  43.45 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  40.94 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  45.21 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  44.06 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  46.76 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  47.14 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  44.2 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  47.45 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  45.14 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  45.59 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  42.18 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  41.89 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  43.36 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  45.93 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  46.38 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  45.93 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  45.19 
 
 		 269 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0667  ribonuclease HI  43.75 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.652902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  43.66 
 
 		 147 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  43.66 
 
 		 147 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  43.66 
 
 		 147 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  42.86 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  45.93 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  43.62 
 
 		 161 aa  106  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  44.52 
 
 		 157 aa  106  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  44.12 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  49.26 
 
 		 225 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  47.76 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  41.73 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  43.38 
 
 		 161 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  43.38 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  47.52 
 
 		 223 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>