More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1553 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  71.49 
 
 		 241 aa  328  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  68.75 
 
 		 239 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  67.92 
 
 		 239 aa  321  8e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  68.62 
 
 		 243 aa  318  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  67.5 
 
 		 239 aa  318  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  74.3 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  64.56 
 
 		 239 aa  316  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  71.56 
 
 		 241 aa  315  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  67.51 
 
 		 241 aa  314  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  75.23 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  66.51 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  63.33 
 
 		 243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  61.89 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  61.51 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  64.02 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  64.02 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  61.02 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  66.67 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  62.79 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  51.22 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  50.24 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  45.75 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  48.58 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  48.54 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  48 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  49.04 
 
 		 245 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  45.37 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  47.57 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  44.86 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  44.86 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  48.45 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  45.02 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  44.34 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  45.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  44.62 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  43 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  50.42 
 
 		 149 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  57.95 
 
 		 114 aa  111  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  57.3 
 
 		 118 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  52.17 
 
 		 126 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  31.87 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  32.13 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  31.82 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0064  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  30.71 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.534501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  31.87 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  31.87 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  32.13 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  32.27 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  30.68 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0157  RNA polymerase sigma factor RpoD  32.4 
 
 		 375 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  33.61 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2414  RNA polymerase sigma factor RpoD  32.4 
 
 		 374 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000700134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  30.23 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  30.23 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1085  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  29.2 
 
 		 320 aa  95.1  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0522379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1113  RNA polymerase sigma factor RpoD  29.8 
 
 		 373 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000049377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  30.28 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  31.08 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2771  sporulation sigma factor SigF  31.97 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000547183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0743  RNA polymerase sigma factor RpoD  29.8 
 
 		 380 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000129687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  31.08 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3019  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.85 
 
 		 373 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000207905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  29.67 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  29.88 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4142  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000821538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1056  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.656155  normal  0.0661655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3983  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00304797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  32 
 
 		 358 aa  92.4  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3813  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3829  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000549151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3903  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.715722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4294  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.728684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4205  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.6 
 
 		 361 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4094  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5514999999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  30.28 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4182  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0460854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  31.95 
 
 		 252 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  30.28 
 
 		 292 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  30.71 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>