164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1285 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1285  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 
183 aa  364  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.247216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0534  SNARE associated Golgi protein  32.06 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000300058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.84 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.33 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  30.26 
 
 
199 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  24.43 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  30.6 
 
 
208 aa  62  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  31.58 
 
 
200 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  34.33 
 
 
248 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.22 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.03 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  28.15 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  32.19 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.92 
 
 
457 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.06 
 
 
211 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 
215 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  23.96 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  32.84 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  26.23 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  32.17 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  27.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  27.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  26.63 
 
 
214 aa  55.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  23.44 
 
 
204 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.66 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  31.16 
 
 
198 aa  54.7  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  23.44 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.34 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  32.82 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  29.77 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.31 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  23.73 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  29.5 
 
 
325 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  32.54 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  24.72 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  30.07 
 
 
206 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  28.17 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  29.57 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.23 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  36.17 
 
 
202 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  34.51 
 
 
146 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  27.37 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  29.58 
 
 
232 aa  50.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.6 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
218 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  34.97 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  26.95 
 
 
208 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  28.65 
 
 
213 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.12 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  30.68 
 
 
225 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  28.57 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
218 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  28.87 
 
 
207 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  26.5 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  25.19 
 
 
212 aa  48.5  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  32.59 
 
 
266 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  29.57 
 
 
228 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  31.62 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  30.77 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  29.11 
 
 
221 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  29.51 
 
 
208 aa  47.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 
212 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  24.74 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  31.78 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 
212 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  26.82 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  26.15 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  29.93 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  28.87 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  30.15 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  21.69 
 
 
204 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  26.15 
 
 
204 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  26.15 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  26.15 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  26.15 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  26.15 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  26.15 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  26.15 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  24.44 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  25.55 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  32.59 
 
 
266 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  26.15 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  26.15 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  30.07 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  26.83 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  28.96 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  28.03 
 
 
221 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  30.07 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5610  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.407349 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.57 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  25.36 
 
 
203 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>