37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3368 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  353  7.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  65.43 
 
 		 168 aa  228  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  64.2 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  60.12 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  41.82 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  36.09 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  36.2 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  34.78 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  32.92 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  31.71 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  34.88 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  32.33 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  32.32 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  28.57 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  41.38 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  31.96 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  42.55 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  26.95 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  31.16 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  37.14 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  33.67 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  47.22 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  29.92 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  32.58 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  27.15 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4540  hypothetical protein  46.81 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  43.48 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  40.43 
 
 		 150 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  28.78 
 
 		 152 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  28.78 
 
 		 152 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  28.78 
 
 		 152 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  31.62 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  44.68 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  26.39 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  29.77 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  29.94 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>