More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2368 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  61.99 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  55.38 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.38 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  46.48 
 
 
273 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  44.98 
 
 
350 aa  215  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  46.25 
 
 
268 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  44.57 
 
 
315 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  46.56 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  46.56 
 
 
295 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  44.7 
 
 
313 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  46.18 
 
 
296 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  46.56 
 
 
296 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  42.75 
 
 
271 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  46.56 
 
 
296 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  46.56 
 
 
296 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  45.11 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  41.38 
 
 
278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  43.92 
 
 
263 aa  195  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.18 
 
 
286 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  45.63 
 
 
271 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
286 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
286 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
286 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  42.16 
 
 
309 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  45.2 
 
 
248 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  44.62 
 
 
259 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.18 
 
 
302 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  44.98 
 
 
303 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  40.98 
 
 
282 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
286 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
286 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  45.38 
 
 
257 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  45.38 
 
 
257 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  45.38 
 
 
257 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  37.8 
 
 
265 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  48.68 
 
 
302 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  47.97 
 
 
281 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  38.81 
 
 
239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  36.48 
 
 
296 aa  152  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  34.96 
 
 
249 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  41.38 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  40.7 
 
 
258 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  40.7 
 
 
258 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.91 
 
 
256 aa  143  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 
249 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
248 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
249 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  40.23 
 
 
253 aa  142  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  31.69 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  34.01 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  32.9 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  37.5 
 
 
258 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
263 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.75 
 
 
258 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 
247 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  34.6 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  36.16 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  32.62 
 
 
249 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  32.62 
 
 
249 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  39.11 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  37.17 
 
 
244 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  30.11 
 
 
257 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  38.07 
 
 
350 aa  137  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  31.54 
 
 
275 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  38.11 
 
 
250 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  34.62 
 
 
248 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.99 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
264 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  33.05 
 
 
252 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  31.65 
 
 
252 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  34.98 
 
 
268 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  30.4 
 
 
247 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  35.57 
 
 
260 aa  135  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
490 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  35.35 
 
 
275 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  36.19 
 
 
260 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  32.26 
 
 
250 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  31.65 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  34.51 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  36.29 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  30.98 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  34.41 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  37.6 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  31.44 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  44.55 
 
 
246 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  35.98 
 
 
262 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  36.68 
 
 
275 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  35.92 
 
 
267 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  29.91 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  29.92 
 
 
418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  36.18 
 
 
275 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 
259 aa  132  6e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>