84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1579 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  78.64 
 
 
507 aa  764    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  78.56 
 
 
516 aa  762    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  78.38 
 
 
502 aa  735    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  79.23 
 
 
504 aa  765    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  77.35 
 
 
506 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  100 
 
 
498 aa  974    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  68.15 
 
 
511 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  67.96 
 
 
498 aa  595  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  66.4 
 
 
500 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  62.2 
 
 
513 aa  578  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  65.42 
 
 
514 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  63.24 
 
 
511 aa  578  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  64.2 
 
 
510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  61.77 
 
 
504 aa  568  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  60.76 
 
 
503 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  60.48 
 
 
526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  61.77 
 
 
504 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  62.32 
 
 
499 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  62.32 
 
 
500 aa  551  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  62.32 
 
 
499 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  61.91 
 
 
498 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  66.19 
 
 
520 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  59.35 
 
 
490 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  57.11 
 
 
504 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  55.98 
 
 
492 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  29 
 
 
537 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  28.05 
 
 
744 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  27.12 
 
 
655 aa  55.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  24.23 
 
 
250 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.54 
 
 
580 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  27.71 
 
 
524 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  29.06 
 
 
595 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  27.31 
 
 
659 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.35 
 
 
628 aa  50.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  29.18 
 
 
1725 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  29.18 
 
 
1725 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  29.18 
 
 
1725 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  29.18 
 
 
1725 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  29.18 
 
 
1834 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  29.18 
 
 
1851 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  29.18 
 
 
1851 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.94 
 
 
908 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.4 
 
 
1202 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  28.76 
 
 
1784 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  27.9 
 
 
959 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.79 
 
 
1174 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.94 
 
 
908 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  31.17 
 
 
1076 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
1527 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.33 
 
 
1707 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  26.17 
 
 
608 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  26.17 
 
 
608 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
1527 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  25.3 
 
 
523 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
1527 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  28.57 
 
 
1673 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  28.51 
 
 
1123 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  29.91 
 
 
582 aa  47  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  28.51 
 
 
1107 aa  47  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.66 
 
 
1610 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  27.54 
 
 
1369 aa  47  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  29.63 
 
 
581 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.66 
 
 
1640 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1987  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.4 
 
 
1145 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  24.09 
 
 
611 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25 
 
 
1157 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  30.61 
 
 
550 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.27 
 
 
837 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.42 
 
 
508 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  29.92 
 
 
554 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  29.92 
 
 
554 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  32.64 
 
 
645 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3390  cell division FtsK/SpoIIIE  31.52 
 
 
1477 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0389  DNA translocase FtsK  25.85 
 
 
1068 aa  44.3  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0445802  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  29.2 
 
 
664 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  26.73 
 
 
360 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  37.1 
 
 
572 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  25.4 
 
 
1299 aa  43.9  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1683  cell division protein FtsK/SpoIIIE  25.82 
 
 
1187 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  25.4 
 
 
1310 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.4 
 
 
1310 aa  43.5  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.42 
 
 
763 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3303  DNA translocase FtsK  26.81 
 
 
1430 aa  43.5  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190344  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  30.72 
 
 
1104 aa  43.5  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>