More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0191 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  56.86 
 
 		 307 aa  332  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  57.24 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  55.05 
 
 		 311 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  53.75 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  52.43 
 
 		 311 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  55.74 
 
 		 311 aa  310  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  54.75 
 
 		 315 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  57.74 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  54.75 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  54.43 
 
 		 307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  53.77 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  55.99 
 
 		 312 aa  305  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  54.64 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  53.23 
 
 		 315 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  53.23 
 
 		 315 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  53.23 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  54.43 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  50.65 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  53.11 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  53.55 
 
 		 315 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  55.02 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  50.32 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  56.13 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  55.48 
 
 		 312 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  53.31 
 
 		 312 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  54.4 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  50.96 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  54.79 
 
 		 314 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  53.15 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  56.35 
 
 		 313 aa  281  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  53.04 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  52.72 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  45.72 
 
 		 306 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  49.51 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  43.83 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  42.72 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  48.56 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  40.86 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  48.08 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  41.18 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  41.18 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  40.56 
 
 		 314 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  39.65 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  39.65 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  39.65 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  43.79 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  39.86 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  39.51 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  41.87 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  40.21 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  40.85 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  45.22 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  42.16 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  32.98 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  35.38 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  34.41 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  32.41 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31.99 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.74 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.11 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  36.06 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.11 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.41 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.8 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.34 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.24 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  27.55 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>