More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3521 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  52.67 
 
 		 632 aa  648    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  54.88 
 
 		 632 aa  679    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  60.57 
 
 		 627 aa  768    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  53.19 
 
 		 632 aa  653    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  53.87 
 
 		 629 aa  647    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  54.76 
 
 		 651 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  53.3 
 
 		 629 aa  669    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  52.55 
 
 		 629 aa  658    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  52.1 
 
 		 639 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  52.24 
 
 		 635 aa  645    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  55.77 
 
 		 835 aa  642    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  54.47 
 
 		 629 aa  639    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  55.24 
 
 		 631 aa  667    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  59.16 
 
 		 650 aa  719    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 636 aa  1314    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  52.04 
 
 		 639 aa  634  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 		 626 aa  634  1e-180  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  51.52 
 
 		 631 aa  622  1e-177  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  48.63 
 
 		 880 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  49.92 
 
 		 625 aa  592  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  49.58 
 
 		 653 aa  591  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  48.6 
 
 		 650 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  47.56 
 
 		 631 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  49.84 
 
 		 651 aa  580  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  47.85 
 
 		 643 aa  581  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  50.16 
 
 		 644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  47.56 
 
 		 631 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  49.09 
 
 		 650 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  46.6 
 
 		 652 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  47.9 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  47.4 
 
 		 632 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  47.24 
 
 		 632 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  48.1 
 
 		 648 aa  572  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  48.91 
 
 		 670 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  48.73 
 
 		 657 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  47.03 
 
 		 638 aa  570  1e-161  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  48.55 
 
 		 656 aa  570  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  48.78 
 
 		 655 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  49.11 
 
 		 657 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  49.08 
 
 		 660 aa  566  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  47.23 
 
 		 667 aa  560  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  47.67 
 
 		 649 aa  559  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  46.42 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  47.32 
 
 		 664 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  45.02 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  46.45 
 
 		 636 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  46.13 
 
 		 636 aa  554  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  46.23 
 
 		 656 aa  553  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  47 
 
 		 656 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  46.29 
 
 		 649 aa  555  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  47.31 
 
 		 656 aa  553  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 		 664 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  45.72 
 
 		 667 aa  550  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  49.91 
 
 		 651 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  46.18 
 
 		 649 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  46.33 
 
 		 655 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  46.06 
 
 		 658 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  45.97 
 
 		 636 aa  551  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  45.79 
 
 		 660 aa  548  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  46.86 
 
 		 658 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  44.08 
 
 		 657 aa  546  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  46.7 
 
 		 658 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  43.69 
 
 		 664 aa  542  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  47.85 
 
 		 658 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  47.02 
 
 		 656 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  45.07 
 
 		 667 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  43.79 
 
 		 652 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  45.95 
 
 		 655 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  43.97 
 
 		 652 aa  540  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  45.95 
 
 		 655 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  46.09 
 
 		 661 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  45.11 
 
 		 648 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  46.95 
 
 		 655 aa  541  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  44.94 
 
 		 655 aa  538  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  42.93 
 
 		 652 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  43.15 
 
 		 652 aa  536  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  45.94 
 
 		 666 aa  538  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  45.26 
 
 		 673 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  46.61 
 
 		 667 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  47.26 
 
 		 654 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  45.53 
 
 		 658 aa  536  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  46.09 
 
 		 661 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  44.01 
 
 		 667 aa  534  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  47.83 
 
 		 657 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  44.86 
 
 		 657 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  46.91 
 
 		 661 aa  530  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  49.05 
 
 		 648 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  45.94 
 
 		 650 aa  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  45.08 
 
 		 661 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  45.07 
 
 		 638 aa  531  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  46.61 
 
 		 661 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  46.31 
 
 		 680 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  46.18 
 
 		 652 aa  527  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  44.07 
 
 		 715 aa  528  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  46.34 
 
 		 668 aa  528  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  44.24 
 
 		 659 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  47.7 
 
 		 661 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  44.64 
 
 		 663 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  43.64 
 
 		 656 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  44.98 
 
 		 660 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>