150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2767 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  100 
 
 
182 aa  361  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  43.17 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  41.71 
 
 
184 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  36.72 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  34.66 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  35.63 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  34.15 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  33.53 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  32.2 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  36.73 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  34.09 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  31.43 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  31.25 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  32.77 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  32.77 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  32.77 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  30.16 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  31.64 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  32.37 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  29.71 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  29.34 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  29.71 
 
 
163 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  30.15 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  27.71 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  29.81 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  29.44 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  31.33 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  29.55 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  29.94 
 
 
163 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  30.06 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  29.35 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  29.09 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  27.84 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  31.13 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  29.14 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  30.73 
 
 
231 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  32.24 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  26.52 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  30.28 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  30.72 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  26.06 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  28.81 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  27.91 
 
 
239 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
163 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  40.23 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  30.69 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  30.07 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  30.16 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  27.17 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  36.36 
 
 
230 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  28.09 
 
 
239 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  29.1 
 
 
219 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  28.09 
 
 
239 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  29.1 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  29.1 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  29.1 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  29.1 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  29.1 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  23.73 
 
 
165 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  36.56 
 
 
244 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  37.36 
 
 
242 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  37.36 
 
 
242 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  28.65 
 
 
234 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  34.09 
 
 
217 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  34.45 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  34.58 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  29.48 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  25 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  28 
 
 
239 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  28.57 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  28.57 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  32.95 
 
 
251 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  35.48 
 
 
248 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  35.16 
 
 
221 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  32.18 
 
 
230 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  32.22 
 
 
258 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  34.41 
 
 
242 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  35.16 
 
 
243 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  32.22 
 
 
235 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  37.5 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  35.16 
 
 
246 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  26.29 
 
 
210 aa  47.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  27.55 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0148146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  28.09 
 
 
204 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  24.5 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  31.25 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  31.07 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1403  Carbonate dehydratase  24.34 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  31.25 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  35.06 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  32.11 
 
 
209 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  36.96 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  32.95 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  36.96 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  31.19 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  32.71 
 
 
211 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2700  carbonate dehydratase  25.26 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  28.7 
 
 
230 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  28.43 
 
 
109 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>