47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2739 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
584 aa  1208    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4256  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  38.49 
 
 
342 aa  217  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168829  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3222  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.86 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0164  hypothetical protein  35.06 
 
 
321 aa  170  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  43.85 
 
 
193 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0672  hypothetical protein  31.88 
 
 
327 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  44.2 
 
 
195 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  37.1 
 
 
227 aa  157  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  43.82 
 
 
227 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4877  hypothetical protein  31.98 
 
 
414 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5010  hypothetical protein  27.97 
 
 
322 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  41.48 
 
 
200 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3493  hypothetical protein  35.11 
 
 
404 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809088  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5907  hypothetical protein  32.43 
 
 
316 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234146  normal  0.772343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  38.76 
 
 
226 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  39.02 
 
 
284 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  37.85 
 
 
190 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.88 
 
 
261 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2873  hypothetical protein  28.62 
 
 
331 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.789287  hitchhiker  0.000633681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1919  hypothetical protein  30.46 
 
 
349 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120292  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.87 
 
 
266 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.39 
 
 
195 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.52 
 
 
204 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  37.18 
 
 
211 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  34.29 
 
 
192 aa  104  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36 
 
 
199 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.86 
 
 
199 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36 
 
 
199 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0181  hypothetical protein  27.27 
 
 
348 aa  98.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.5 
 
 
324 aa  93.6  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  33.73 
 
 
383 aa  93.6  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3189  hypothetical protein  27.22 
 
 
386 aa  91.3  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  33.73 
 
 
372 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
321 aa  88.2  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  30.16 
 
 
391 aa  82  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39118  predicted protein  32.24 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48622  predicted protein  25.8 
 
 
491 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178439  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3553  hypothetical protein  28.42 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.912743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  30.54 
 
 
363 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4192  hypothetical protein  24.22 
 
 
386 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0163  hypothetical protein  23.22 
 
 
386 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0167  hypothetical protein  23.26 
 
 
386 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0980285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0165  hypothetical protein  25.81 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  29.79 
 
 
234 aa  57  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2658  hypothetical protein  23.56 
 
 
319 aa  48.9  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00785761  hitchhiker  0.0075922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2993  hypothetical protein  32.5 
 
 
209 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3441  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  27.75 
 
 
290 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0629914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>