21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3493 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3493  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  769    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809088  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4877  hypothetical protein  72.01 
 
 
414 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4256  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  40 
 
 
342 aa  190  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168829  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3222  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.95 
 
 
386 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0672  hypothetical protein  38.13 
 
 
327 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.07 
 
 
584 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0164  hypothetical protein  36.58 
 
 
321 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1919  hypothetical protein  36.3 
 
 
349 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120292  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2873  hypothetical protein  27.59 
 
 
331 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.789287  hitchhiker  0.000633681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5010  hypothetical protein  24.52 
 
 
322 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5907  hypothetical protein  27.61 
 
 
316 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234146  normal  0.772343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3189  hypothetical protein  33.11 
 
 
386 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0181  hypothetical protein  28.52 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2658  hypothetical protein  35.38 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00785761  hitchhiker  0.0075922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0165  hypothetical protein  30.43 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0167  hypothetical protein  26.92 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0980285 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39118  predicted protein  29.81 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48622  predicted protein  26.47 
 
 
491 aa  63.9  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178439  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3553  hypothetical protein  24.6 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.912743  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0163  hypothetical protein  25.64 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4192  hypothetical protein  25.51 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>