19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3553 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3553  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  800    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.912743  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0167  hypothetical protein  68.75 
 
 
386 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0980285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0163  hypothetical protein  68.49 
 
 
386 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4192  hypothetical protein  67.45 
 
 
386 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0165  hypothetical protein  58.14 
 
 
388 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0181  hypothetical protein  32.52 
 
 
348 aa  166  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3189  hypothetical protein  32.36 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2873  hypothetical protein  28.29 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.789287  hitchhiker  0.000633681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5010  hypothetical protein  28.65 
 
 
322 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0672  hypothetical protein  26.25 
 
 
327 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0164  hypothetical protein  31.18 
 
 
321 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5907  hypothetical protein  27.75 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234146  normal  0.772343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1919  hypothetical protein  24.92 
 
 
349 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120292  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.42 
 
 
584 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4256  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  24.32 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168829  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3222  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  22.81 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3493  hypothetical protein  24.32 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809088  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4877  hypothetical protein  28.03 
 
 
414 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122035  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2658  hypothetical protein  26.75 
 
 
319 aa  50.4  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00785761  hitchhiker  0.0075922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>