21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5907 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5907  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234146  normal  0.772343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5010  hypothetical protein  34.47 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2873  hypothetical protein  33.79 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.789287  hitchhiker  0.000633681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4256  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.13 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.43 
 
 		 584 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0672  hypothetical protein  34.71 
 
 		 327 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3222  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.3 
 
 		 386 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0164  hypothetical protein  36.82 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1919  hypothetical protein  30.94 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120292  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3493  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809088  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4877  hypothetical protein  28.92 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3189  hypothetical protein  28.57 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3553  hypothetical protein  27.75 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.912743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0181  hypothetical protein  32.09 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0167  hypothetical protein  25.16 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0980285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0163  hypothetical protein  25.08 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0165  hypothetical protein  23.49 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4192  hypothetical protein  25.08 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2658  hypothetical protein  25.14 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00785761  hitchhiker  0.0075922 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48622  predicted protein  30.58 
 
 		 491 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178439  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39118  predicted protein  29.66 
 
 		 396 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>