17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2658 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2658  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  660    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00785761  hitchhiker  0.0075922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4877  hypothetical protein  28.43 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3493  hypothetical protein  35.38 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809088  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5010  hypothetical protein  26.29 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2873  hypothetical protein  26.88 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.789287  hitchhiker  0.000633681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5907  hypothetical protein  25.14 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234146  normal  0.772343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4256  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.61 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3222  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  23.18 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0672  hypothetical protein  26.42 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3553  hypothetical protein  26.75 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.912743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1919  hypothetical protein  29.84 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120292  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0165  hypothetical protein  26.05 
 
 		 388 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  23.56 
 
 		 584 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0164  hypothetical protein  28.07 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3189  hypothetical protein  27.05 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0167  hypothetical protein  24.91 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0980285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4192  hypothetical protein  23.48 
 
 		 386 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>