21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0164 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0164  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0672  hypothetical protein  51.11 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4256  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  39.74 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1919  hypothetical protein  40 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120292  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3222  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  39.44 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.06 
 
 		 584 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3493  hypothetical protein  36.49 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809088  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4877  hypothetical protein  34.24 
 
 		 414 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0181  hypothetical protein  32.06 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5907  hypothetical protein  36.82 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234146  normal  0.772343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5010  hypothetical protein  32.11 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3189  hypothetical protein  36.9 
 
 		 386 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2873  hypothetical protein  27.46 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.789287  hitchhiker  0.000633681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3553  hypothetical protein  31.18 
 
 		 390 aa  89.7  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.912743  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4192  hypothetical protein  26.81 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0163  hypothetical protein  27.06 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0165  hypothetical protein  32.91 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0167  hypothetical protein  27.2 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0980285 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39118  predicted protein  35.04 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48622  predicted protein  31.15 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2658  hypothetical protein  28.07 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00785761  hitchhiker  0.0075922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>