21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4877 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4877  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  807    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3493  hypothetical protein  74.07 
 
 		 404 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809088  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3222  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  40.54 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4256  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  38.38 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.83 
 
 		 584 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0672  hypothetical protein  35.86 
 
 		 327 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0164  hypothetical protein  35.22 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1919  hypothetical protein  34.93 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120292  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2873  hypothetical protein  27.05 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.789287  hitchhiker  0.000633681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5010  hypothetical protein  24.66 
 
 		 322 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5907  hypothetical protein  28.92 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234146  normal  0.772343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3189  hypothetical protein  32.1 
 
 		 386 aa  99.8  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39118  predicted protein  30.58 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0181  hypothetical protein  27.6 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2658  hypothetical protein  28.43 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00785761  hitchhiker  0.0075922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0167  hypothetical protein  27.07 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0980285 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48622  predicted protein  29.11 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178439  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0163  hypothetical protein  29.45 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4192  hypothetical protein  25.11 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0165  hypothetical protein  27.95 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3553  hypothetical protein  28.29 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.912743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>