21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2873 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2873  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  687    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.789287  hitchhiker  0.000633681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5010  hypothetical protein  43.51 
 
 
322 aa  298  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5907  hypothetical protein  33.79 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234146  normal  0.772343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3222  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.25 
 
 
386 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4256  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.9 
 
 
342 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168829  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0672  hypothetical protein  29.17 
 
 
327 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.62 
 
 
584 aa  136  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3493  hypothetical protein  27.59 
 
 
404 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809088  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4877  hypothetical protein  27.05 
 
 
414 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0164  hypothetical protein  27.46 
 
 
321 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1919  hypothetical protein  26.67 
 
 
349 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120292  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3189  hypothetical protein  26.06 
 
 
386 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0181  hypothetical protein  26.91 
 
 
348 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3553  hypothetical protein  28.29 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.912743  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0165  hypothetical protein  27.48 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0167  hypothetical protein  28.12 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0980285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4192  hypothetical protein  26.72 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0163  hypothetical protein  29.89 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2658  hypothetical protein  26.88 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00785761  hitchhiker  0.0075922 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39118  predicted protein  26.79 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48622  predicted protein  30.83 
 
 
491 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>