More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2651 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2651  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 120 aa  243  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.45 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  34.86 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  33.03 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.03 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  33.06 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.03 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.86 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32.41 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.03 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  31.68 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  32.41 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.31 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  32.08 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  33 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.06 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  34.82 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  33.03 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  31.97 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  32.11 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  33.33 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32.67 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  36.61 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.03 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.19 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  31.19 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.52 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  33.93 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  33.93 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.23 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.23 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.91 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  33.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  31.36 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  33.04 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  29.31 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  33.93 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  33.93 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  33.93 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  33.93 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  30.28 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  32.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  32.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.45 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32.08 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  33.04 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  33.93 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  33.93 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  31.25 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  32.14 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  33.93 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  32.14 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05220  iron-sulfur cluster assembly-related protein, putative  31.93 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  32.14 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  32.14 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  33.04 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  31.25 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  30.19 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  32.14 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  32.14 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.07 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  30.97 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1354  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  35.45 
 
 		 488 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  33.04 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  31.25 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  32.14 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.21 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  32.14 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  33.04 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  31.25 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  27.03 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  30.36 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.46 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>