More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2239 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2239  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 146 aa  303  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.98751  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4315  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 123 aa  124  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.915809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 150 aa  83.6  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  35.2 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  33.03 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  36.7 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  32.74 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  36.11 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  34.82 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  34.82 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  30 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  34.26 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5083  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  35.4 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  35.09 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  30.08 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2625  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318955  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  36.11 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  33.94 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  34.95 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 129 aa  67  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  30.63 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  31.48 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  32.41 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  33.96 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  31.45 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  33.96 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  34.58 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>