More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1686 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1686  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 356 aa  728    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  50.46 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0533  LacI family transcription regulator  48.07 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.985534  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0899  LacI family transcription regulator  39.29 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2386  LacI family transcription regulator  38.18 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737452  normal  0.472555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  38.51 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.44 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.44 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.44 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 342 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.36 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.04 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 333 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.94 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.63 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.24 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  29.64 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.64 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.64 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  29.64 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.64 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.64 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.55 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.64 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.95 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.64 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  29.91 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.24 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  28.32 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.24 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.53 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  28.23 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.94 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.94 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.94 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.25 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  32.43 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  29.26 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  28.26 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.95 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 336 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  32.59 
 
 		 359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  27.84 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  32.16 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.75 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  32.9 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.99 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  29.36 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.93 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  29.9 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  27.33 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  31.9 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 347 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  27.54 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  25.88 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01255  putative LacI-family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  30.81 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  30.06 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  31.32 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.97 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  30.81 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.32 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.38 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  32.44 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  28.15 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.73 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>