More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1204 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1204  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
601 aa  1247    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00717108  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
619 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 
593 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
594 aa  571  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
593 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
593 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
594 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
595 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
598 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
593 aa  557  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
594 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
600 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
591 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
591 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
591 aa  551  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
591 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
591 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
591 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
597 aa  555  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
591 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
591 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
590 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
591 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
601 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
589 aa  549  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
592 aa  548  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
586 aa  546  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
613 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  47 
 
 
594 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
596 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
606 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
600 aa  538  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
590 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
591 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
600 aa  539  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
618 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
592 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
608 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
594 aa  537  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
602 aa  534  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
627 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
588 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
585 aa  531  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
588 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
588 aa  531  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
599 aa  528  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
603 aa  527  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1329  aspartyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
616 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519796  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
599 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
597 aa  524  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
599 aa  525  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
592 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
596 aa  519  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2533  aspartyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
603 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
598 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
610 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
591 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
597 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
595 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1418  aspartyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
603 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
602 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1316  aspartyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
603 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
588 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
591 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
589 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
594 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
592 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
597 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
600 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
614 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
582 aa  509  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
583 aa  510  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
599 aa  511  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
602 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
600 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
600 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
600 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
597 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
600 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
600 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
605 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
626 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
598 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
600 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
600 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
598 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
591 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
591 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
600 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
601 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
594 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
602 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
600 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
597 aa  508  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
595 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
600 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
598 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
599 aa  508  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
600 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>