66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2177 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  88.41 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06440  sugar phosphate isomerase/epimerase  64.97 
 
 		 300 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.21 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0137  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.15 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.66 
 
 		 298 aa  315  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0606369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  59.64 
 
 		 285 aa  312  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  56.78 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  54.01 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.88 
 
 		 290 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.834913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.57 
 
 		 269 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  50 
 
 		 266 aa  251  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.44 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.44 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  50 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  46.82 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  49.09 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.76 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2882  xylose isomerase domain-containing protein  44.32 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1856  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.26 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  44.3 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  38.04 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.97 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.54 
 
 		 394 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.76 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.84 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  40.3 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  40.3 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  39.93 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  39.55 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  39.55 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  39.55 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.73 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.87 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.65 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  26.69 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  33.85 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  26.9 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.58 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3702  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.37 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  32.5 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  27.98 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  28.4 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5095  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.78 
 
 		 604 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  26.44 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4578  xylose isomerase domain-containing protein  32.5 
 
 		 137 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.615471  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4090  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.18 
 
 		 645 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  28.03 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.97 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3597  xylose isomerase domain-containing protein  29.89 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.791675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1876  xylose isomerase domain-containing protein  28.14 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1854  xylose isomerase-like TIM barrel  26.67 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.151277  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.72 
 
 		 624 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  30.34 
 
 		 629 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1942  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.83 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.44 
 
 		 638 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1896  xylose isomerase-like TIM barrel  26.47 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0259  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.3 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4666  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.63 
 
 		 630 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.735725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1560  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.71 
 
 		 632 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.288895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4905  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  31.9 
 
 		 633 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  25.83 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5194  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30 
 
 		 630 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>