237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1051 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1051  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  100 
 
 
371 aa  742    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  0.0668071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2216  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  41.21 
 
 
344 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4123  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.53 
 
 
361 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472584  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3643  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.35 
 
 
340 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2298  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.02 
 
 
345 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211923  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0075  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  29.76 
 
 
336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2088  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.03 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.69 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3001  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.14 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.97 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2079  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.62 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.509497  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2475  monosaccharide-transporting ATPase  25.57 
 
 
321 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.65 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.95 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0867  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000788488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  25.08 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2801  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.87 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.33 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3130  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.47 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910041  hitchhiker  0.00277477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2124  Monosaccharide-transporting ATPase  27.92 
 
 
316 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.48 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.27 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4235  D-ribose transporter subunit RbsB  26.28 
 
 
295 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000930744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  24.58 
 
 
289 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4525  D-ribose transporter subunit RbsB  26.28 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00203677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.44 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  25.54 
 
 
295 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1017  sugar-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.67 
 
 
319 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.353153  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4554  D-allose transporter subunit  28.19 
 
 
313 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03960  D-allose transporter subunit  28.19 
 
 
311 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3938  D-allose transporter subunit  28.19 
 
 
311 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03920  hypothetical protein  28.19 
 
 
311 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4489  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.68 
 
 
334 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  decreased coverage  0.000667621 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1336  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  28.16 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.454554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  25.08 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4942  D-xylose transporter subunit XylF  30.13 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0258127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03418  D-xylose transporter subunit  30 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0144  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3903  Monosaccharide-transporting ATPase  27.8 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  26.07 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0778  ribose ABC transporter periplasmic-binding protein  24.34 
 
 
353 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3769  D-xylose transporter subunit XylF  30 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.723738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3889  D-xylose transporter subunit XylF  30 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03369  hypothetical protein  30 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4062  D-xylose transporter subunit XylF  30 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0148  D-xylose transporter subunit XylF  30 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0503  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.35 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6817  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.2 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0294191  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0798  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  38.95 
 
 
308 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1369  D-ribose transporter subunit RbsB  26.34 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3975  D-ribose transporter subunit RbsB  25.8 
 
 
296 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0740173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2035  Monosaccharide-transporting ATPase  24.68 
 
 
309 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0343  D-ribose transporter subunit RbsB  24.39 
 
 
292 aa  56.2  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2413  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.19 
 
 
347 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50663 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0580  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  37.89 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0701  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  37.89 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.68 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876756  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0583  monosaccharide-transporting ATPase  25.36 
 
 
307 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0737  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  37.89 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.926456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0636  ribose ABC transporter ribose-binding protein  37.89 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0579  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  37.89 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0669  ribose ABC transporter ribose-binding protein  37.89 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0079  D-xylose transporter subunit XylF  27.97 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0726  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  37.89 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9854199999999997e-37 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2133  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.11 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3422  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.33 
 
 
310 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544688  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0057  D-xylose transporter subunit XylF  28.63 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4101  D-xylose transporter subunit XylF  28.63 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3687  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.33 
 
 
310 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.743219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1583  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.08 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0401008  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1126  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.08 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1798  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.48 
 
 
324 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1606  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.08 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.099451  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06143  D-ribose transporter subunit RbsB  24.23 
 
 
292 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1401  ribose ABC transporter, substrate binding protein  24.32 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2239  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.46 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2302  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.36 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.288847  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4637  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  36.84 
 
 
308 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.146123  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2376  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.58 
 
 
376 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4172  D-ribose transporter subunit RbsB  34.07 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000287299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0155  D-xylose transporter subunit XylF  27.31 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2399  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  26.88 
 
 
310 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4745  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  30.08 
 
 
316 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193376  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3956  D-xylose transporter subunit XylF  29.82 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.6 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0008  D-ribose transporter subunit RbsB  24.53 
 
 
294 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0577  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.48 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.130999  normal  0.503483 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1581  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.62 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0970  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.51 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3003  D-xylose ABC transporter, periplasmic-D xylose binding protein  31.38 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0589453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1997  ABC ribose transporter, periplasmic ligand binding protein  27.2 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2579  ABC transporter substrate-binding protein  26.12 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1503  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.86 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39350  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  24.7 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000339  ribose ABC transport system ribose-binding protein RbsB  24.81 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6148  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  26.94 
 
 
348 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0762309  hitchhiker  0.00309202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  29.05 
 
 
445 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.86 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39428  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5755  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.67 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.11537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>