More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1254 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 335 aa  669    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 		 334 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  50.6 
 
 		 339 aa  326  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.49 
 
 		 336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.39 
 
 		 333 aa  311  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 		 335 aa  308  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 		 334 aa  308  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  45.24 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.85 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  47.02 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.13 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 		 347 aa  279  4e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  46.41 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.34 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  45.54 
 
 		 336 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.24 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.2 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.18 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  46.71 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.32 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  44.91 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  47.31 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  44.44 
 
 		 336 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 		 312 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  44.01 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  44.01 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  44.31 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  45.21 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1687  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  46.45 
 
 		 340 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.930254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  45.21 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  45.51 
 
 		 336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 		 336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  44.51 
 
 		 337 aa  268  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  45.21 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01444  D-ala-D-ala transporter subunit  46.45 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.45 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0198405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.45 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2098  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  46.45 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1675  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  46.45 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.925292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.18 
 
 		 335 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01456  hypothetical protein  46.45 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  45.35 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  44.61 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  44.61 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1571  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  46.15 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.97 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  44.05 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 381 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  43.45 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  44.31 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  43.79 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2419  ABC transporter D-Ala-D-Ala-binding inner membrane protein  42.51 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279427  hitchhiker  0.0000166625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  44.08 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  44.08 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.06 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268081  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  43.2 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  42.82 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.97 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 		 347 aa  258  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  43.37 
 
 		 335 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  44.31 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  43.07 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  42.2 
 
 		 313 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 		 311 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>