119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0414 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0414  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  455  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0171  glutamine amidotransferase-like protein  29.07 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  25.69 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  30.07 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  24.41 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  25 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  26.91 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1186  hypothetical protein  27.93 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  29.53 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  24.18 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  24.18 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  28.19 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  24.9 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  29.86 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  19.7 
 
 		 287 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  29.86 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  29.86 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  29.86 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  25.78 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  26.75 
 
 		 275 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  26.63 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  24.79 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  25.56 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  29.17 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1099  glutamine amidotransferase, class-II  26.29 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.161791 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  29.94 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  29.17 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  26.06 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1610  glutamine amidotransferase-like protein  26.67 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  28.47 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  28.28 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  26.22 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  25.93 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  30.58 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  27.52 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  27.33 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  27.59 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1869  amidotransferase  28.67 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.120168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  25.93 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  31.91 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  29.79 
 
 		 270 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  27.46 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  29.67 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  27.56 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  25.62 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  28.39 
 
 		 287 aa  48.5  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  28.39 
 
 		 287 aa  48.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  27.78 
 
 		 279 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  23.68 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0879  glutamine amidotransferase, class-II  30.41 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.546334  normal  0.0807844 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  23.68 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  23.68 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  28.87 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  23.68 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  23.68 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  29.17 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  23.64 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  23.68 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  27.39 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  23.75 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  28.87 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  28.47 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  23.68 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  23.68 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  24.23 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  24.23 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  24.23 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  27.81 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  24.23 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  24.23 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  23.08 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  26.23 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  24.14 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  23.68 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  26.24 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0989  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.879839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  21.29 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  22.45 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0457  glutamine amidotransferase-like protein  23.89 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000211825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  27.78 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  28.17 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  25.49 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  26.24 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  25.95 
 
 		 255 aa  45.1  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  27.59 
 
 		 273 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  25.53 
 
 		 257 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  26.83 
 
 		 265 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  24.52 
 
 		 268 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1034  glutamine amidotransferase class-II  30.34 
 
 		 261 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0785028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  26.95 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0143  glutamine amidotransferase-like protein  23.48 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1856  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0526188  normal  0.336481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  25.53 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  26.24 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  25.53 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  22.66 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  26.54 
 
 		 279 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  27.56 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  27.27 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  26.54 
 
 		 279 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>