35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4238 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.41 
 
 
693 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  100 
 
 
643 aa  1295    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.24 
 
 
638 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4239  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.17 
 
 
534 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3699  endoproteinase Arg-C  45.17 
 
 
483 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35914  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0494  endoproteinase Arg-C  47.13 
 
 
488 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.072982  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02206  endoproteinase Arg-C  36.04 
 
 
465 aa  232  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02094  endoproteinase Arg-C  34.95 
 
 
434 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.246327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0919  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  33.67 
 
 
462 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09900  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  33.33 
 
 
462 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00818916  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1951  hypothetical protein  30.55 
 
 
667 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.76 
 
 
606 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  28.07 
 
 
868 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  44.78 
 
 
595 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  26.1 
 
 
823 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  41.55 
 
 
815 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  30.29 
 
 
514 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  41.22 
 
 
269 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  37.96 
 
 
808 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  36.81 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0553  extracellular protease, putative  28.69 
 
 
940 aa  83.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  38.58 
 
 
427 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  30.08 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  33.76 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  72.8  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  30.11 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  32.56 
 
 
152 aa  57.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  32.59 
 
 
633 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  32.17 
 
 
403 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  30.66 
 
 
290 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  29.1 
 
 
207 aa  50.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  29.77 
 
 
176 aa  49.7  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  28.12 
 
 
232 aa  47.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  29.32 
 
 
303 aa  43.9  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  39.13 
 
 
144 aa  43.9  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>