More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3591 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  477  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 229 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3589  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  41.94 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.27 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.27 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  42.18 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3954  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.24 
 
 		 216 aa  99.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  32.34 
 
 		 210 aa  99  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.76 
 
 		 211 aa  95.5  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  30.52 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  30.35 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  33.17 
 
 		 215 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 216 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  31.43 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  32.67 
 
 		 217 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  30.94 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.77 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0029  two component transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0011  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02260  Response regulator, LuxR family (CheY, HTH domains)  32.08 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.55 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  29.9 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  32.23 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.92 
 
 		 215 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  29.9 
 
 		 215 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2713  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 216 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  29.86 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  29.35 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.8 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  34.43 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  32.86 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  31.6 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2921  two component LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  29.35 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  29.35 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  29.41 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  29.35 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  32.87 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  29.41 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  29.35 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>